בופר TAE הוא תמיסת מלחים המכילה טריס, חומצה אצטית ו- EDTA.
לצורך הרצת DNA בג'ל אגרוז (Gel electrophoresis) יש צורך בבופר בעל רמת חומציות קבועה (בד"כ pH 8), שיאפשר המסה של ה- DNA במים. רמת החוצמיות נקבעת ע"י תמיסת הטריס-אצטט ואילו ה- EDTA משמש להרחקת יונים דו-ערכיים. יונים דו-ערכיים כגון מגנזיום חיוניים לפעילותם של אנזימים המפרקים חומצות גרעין, כך שנוכחות EDTA בתמיסה תגן על חומצות הגרעין מפני פירוק.
Gel electrophoresis (ויקיפדיה)
בופר TAE לא ישנה את אופי הריצה של ה- DNA, מה שמאפשר הפרדת מיקטעי DNA על-פי מטען וגודל.
בהשוואה לבופרים אחרים (למשל בופר TBE המכיל חומצה בורית במקום חומצה אצטית), בופר TAE לא יפריע לתהליכים אנזימתיים הנדרשים לעיתים לאחר הפרדת ה- DNA בג'ל, כגון ריאקציות חיתוך או ליגציה (חיבור מקטעים). לעומת זאת, הרצה בבופר TBE שומרת טוב יותר על שלמות ה- DNA ועל שלמות קומפלקסים של DNA-חלבון.
מאת: ד"ר נטלי יבגי-אוחנה
המחלקה לבקרה ביולוגית
מכון ויצמן למדע
הערה לגולשים
אם אתם חושבים שההסברים אינם ברורים מספיק או אם יש לכם שאלות הקשורות לנושא, אתם מוזמנים לכתוב על כך בפורום. אנו נתייחס להערותיכם. הצעות לשיפור וביקורת בונה תמיד מתקבלות בברכה.
